无需编程 | 联用「chatGPT」和「TBtools」实现你的 idea，开发你梦寐以求的工具

sockstack / 196 / 2023-11-14 11:47:47

<p><span style="color: red; font-size: 18px">ChatGPT 可用网址，仅供交流学习使用，如对您有所帮助，请收藏并推荐给需要的朋友。</span><br><a href="https://ckai.xyz/?sockstack&section=detail" target="__blank">https://ckai.xyz</a><br><br></p> <article class="_2rhmJa"><h3>写在前面</h3>
<p>万万没想到 chatGPT，我玩了整整一个周末。当然，我不是在玩 chatGPT。而是在想，这样一个工具，我们如何更好的使用他，从而解决日常生信数据分析中的简单问题。要知道，绝大多数湿实验科研朋友的数据分析需求，其实是简单的文本处理。TBtools 当然，可以满足不少需求，但总有一些，并不如此。于是，大伙还是要去求助某某。<br>
chatGPT 可以相对较好的理解我们想说的话。我测试了下，对于简单的文本处理工作，他完全可以直接生成可用代码。<br>
为此，我决定直接对 TBtools 和 CLI Program Wrapper Creator 进行改造，让他们支持直接脚本编写执行（当然，同时也支持了其他各类语言的脚本，只是需要插件开发者打包一个解释器，如python或perl等）。如此，我们就完全可以让「chatGPT」和「TBtools」联动，实现我们的「春秋大梦」。</p>
<h3>示例 2：Fasta序列批量提取</h3>
<p>跟 chatGPT 说</p>
<div class="_2Uzcx_">
<button class="VJbwyy" type="button" aria-label="复制代码"><i aria-label="icon: copy" class="anticon anticon-copy"><svg viewbox="64 64 896 896" focusable="false" class="" data-icon="copy" width="1em" height="1em" fill="currentColor" aria-hidden="true"><path d="M832 64H296c-4.4 0-8 3.6-8 8v56c0 4.4 3.6 8 8 8h496v688c0 4.4 3.6 8 8 8h56c4.4 0 8-3.6 8-8V96c0-17.7-14.3-32-32-32zM704 192H192c-17.7 0-32 14.3-32 32v530.7c0 8.5 3.4 16.6 9.4 22.6l173.3 173.3c2.2 2.2 4.7 4 7.4 5.5v1.9h4.2c3.5 1.3 7.2 2 11 2H704c17.7 0 32-14.3 32-32V224c0-17.7-14.3-32-32-32zM350 856.2L263.9 770H350v86.2zM664 888H414V746c0-22.1-17.9-40-40-40H232V264h432v624z"></path></svg></i></button><pre class="line-numbers  language-undefined"><code class="  language-undefined">用 java 代码实现一个命令行脚本，接受三个参数，第一个是一个ID列表文件，每行一个 ID，第二个是一个 Fasta 序列文件，第三个是输出文件。需要提取 Fasta 序列文件中 ID 在列表文件中存在的序列，输出到输出文件
<span aria-hidden="true" class="line-numbers-rows"><span></span></span></code></pre>
</div>
<p>结果如下</p>
<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 1668px; background-color: transparent;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 238.28%;"></div>
<div class="image-view" data-width="2111" data-height="5030"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-4c6941e3794cf143.png" data-original-width="2111" data-original-height="5030" data-original-format="image/png" data-original-filesize="707550" data-image-index="0" style="cursor: zoom-in;" class="" src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-4c6941e3794cf143.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1200/format/webp"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
<p>代码直接复制到 TBtools 中，简单填充界面</p>
<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 338px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 48.26%;"></div>
<div class="image-view" data-width="2982" data-height="1439"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-f51c4ad5a3c90e27.png" data-original-width="2982" data-original-height="1439" data-original-format="image/png" data-original-filesize="218190" data-image-index="1" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
完成插件开发，惊呆了！
<h3>示例 1：表格行批量提取软件</h3>
<p>我们有一个基因表达量矩阵，可能有100Mb，我们需要从里面提取是100个基因的表达量。我用一句话描述了任务需求，发给「chatGPT」</p>
<div class="_2Uzcx_">
<button class="VJbwyy" type="button" aria-label="复制代码"><i aria-label="icon: copy" class="anticon anticon-copy"><svg viewbox="64 64 896 896" focusable="false" class="" data-icon="copy" width="1em" height="1em" fill="currentColor" aria-hidden="true"><path d="M832 64H296c-4.4 0-8 3.6-8 8v56c0 4.4 3.6 8 8 8h496v688c0 4.4 3.6 8 8 8h56c4.4 0 8-3.6 8-8V96c0-17.7-14.3-32-32-32zM704 192H192c-17.7 0-32 14.3-32 32v530.7c0 8.5 3.4 16.6 9.4 22.6l173.3 173.3c2.2 2.2 4.7 4 7.4 5.5v1.9h4.2c3.5 1.3 7.2 2 11 2H704c17.7 0 32-14.3 32-32V224c0-17.7-14.3-32-32-32zM350 856.2L263.9 770H350v86.2zM664 888H414V746c0-22.1-17.9-40-40-40H232V264h432v624z"></path></svg></i></button><pre class="line-numbers  language-csharp"><code class="  language-csharp"><span class="token preprocessor property"># chatGPT 镜像链接，无需登录，直接使用</span>
https<span class="token punctuation">:</span><span class="token operator">/</span><span class="token operator">/</span>gpt<span class="token punctuation">.</span>chatapi<span class="token punctuation">.</span>art<span class="token operator">/</span>
<span aria-hidden="true" class="line-numbers-rows"><span></span><span></span></span></code></pre>
</div>
<p>具体描述如下</p>
<div class="_2Uzcx_">
<button class="VJbwyy" type="button" aria-label="复制代码"><i aria-label="icon: copy" class="anticon anticon-copy"><svg viewbox="64 64 896 896" focusable="false" class="" data-icon="copy" width="1em" height="1em" fill="currentColor" aria-hidden="true"><path d="M832 64H296c-4.4 0-8 3.6-8 8v56c0 4.4 3.6 8 8 8h496v688c0 4.4 3.6 8 8 8h56c4.4 0 8-3.6 8-8V96c0-17.7-14.3-32-32-32zM704 192H192c-17.7 0-32 14.3-32 32v530.7c0 8.5 3.4 16.6 9.4 22.6l173.3 173.3c2.2 2.2 4.7 4 7.4 5.5v1.9h4.2c3.5 1.3 7.2 2 11 2H704c17.7 0 32-14.3 32-32V224c0-17.7-14.3-32-32-32zM350 856.2L263.9 770H350v86.2zM664 888H414V746c0-22.1-17.9-40-40-40H232V264h432v624z"></path></svg></i></button><pre class="line-numbers  language-undefined"><code class="  language-undefined">使用java代码实现，接受三个命令行参数，第一个参数是接受一个表格文件，表格文件中有行名，有列名，第二个参数是一个ID列表文件，每一行是一个ID，第三个参数是输出文件。这个代码主要功能是，按照ID列表文件中的ID提取表格文件中第一列匹配到ID的所有行，匹配内容输出到输出文件。注意，最终文件同样需要有行名和列名。
<span aria-hidden="true" class="line-numbers-rows"><span></span></span></code></pre>
</div>
<p>得到结果如下</p>
<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 1198px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 171.09%;"></div>
<div class="image-view" data-width="2148" data-height="3675"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-d5a096ad251262fb.png" data-original-width="2148" data-original-height="3675" data-original-format="image/png" data-original-filesize="633423" data-image-index="2" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
<p>打开 TBtools（注意，你需要升级到1.106或者更高版本，使用安装器），转到 「CLI Program Wrapper Creator」功能（注意，插件也需要更新一下），点击「Click X for Script Input」</p>
<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 332px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 47.33%;"></div>
<div class="image-view" data-width="2474" data-height="1171"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-4b078ef90dd76784.png" data-original-width="2474" data-original-height="1171" data-original-format="image/png" data-original-filesize="99555" data-image-index="3" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
设置一下文件名，黏贴从 chatGPT 复制过来的代码<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 332px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 47.33%;"></div>
<div class="image-view" data-width="2474" data-height="1171"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-a9c83dd89d89c20a.png" data-original-width="2474" data-original-height="1171" data-original-format="image/png" data-original-filesize="183008" data-image-index="4" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
<p>按照我们描述的需求和chatGPT给出的使用方法（其实也就是我们的需求）</p>
<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 486px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 41.61%;"></div>
<div class="image-view" data-width="1168" data-height="486"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-204eb9325faaf6ed.png" data-original-width="1168" data-original-height="486" data-original-format="image/png" data-original-filesize="69157" data-image-index="5" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
配置界面如下<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 267px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 38.14%;"></div>
<div class="image-view" data-width="2926" data-height="1116"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-d357308fc65e01f5.png" data-original-width="2926" data-original-height="1116" data-original-format="image/png" data-original-filesize="184566" data-image-index="6" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
大功告成，我们测试一下<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 267px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 38.14%;"></div>
<div class="image-view" data-width="2926" data-height="1116"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-1caca999a6534c47.png" data-original-width="2926" data-original-height="1116" data-original-format="image/png" data-original-filesize="274106" data-image-index="7" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
直接复制这些报错，丢给「chatGPT」<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 1492px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 213.07%;"></div>
<div class="image-view" data-width="1615" data-height="3441"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-015e61133d282e32.png" data-original-width="1615" data-original-height="3441" data-original-format="image/png" data-original-filesize="614791" data-image-index="8" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
运行了下，发现没有正确提取<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 267px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 38.14%;"></div>
<div class="image-view" data-width="2926" data-height="1116"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-462d8abf97c0e848.png" data-original-width="2926" data-original-height="1116" data-original-format="image/png" data-original-filesize="168349" data-image-index="9" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
<p>让他重新写一个。结果网页链接断开了，镜像不稳定。没事，重新来</p>
<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 725px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 103.53000000000002%;"></div>
<div class="image-view" data-width="2123" data-height="2198"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-83a8f8c20f484fd7.png" data-original-width="2123" data-original-height="2198" data-original-format="image/png" data-original-filesize="492402" data-image-index="10" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
更新代码，再次尝试<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 267px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 38.14%;"></div>
<div class="image-view" data-width="2926" data-height="1116"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-3dc3ef1483a03d5c.png" data-original-width="2926" data-original-height="1116" data-original-format="image/png" data-original-filesize="232722" data-image-index="11" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
又报错了，让他改，反正 chatGPT 真的是一个机器......「无情的我.....」<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 953px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 136.03%;"></div>
<div class="image-view" data-width="1596" data-height="2171"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-f4b14ae2491992e7.png" data-original-width="1596" data-original-height="2171" data-original-format="image/png" data-original-filesize="347205" data-image-index="12" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
完成.....<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 267px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 38.14%;"></div>
<div class="image-view" data-width="2926" data-height="1116"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-b99aa9c7fa2aea68.png" data-original-width="2926" data-original-height="1116" data-original-format="image/png" data-original-filesize="168313" data-image-index="13" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
虽然过程有点波折，不过我们成功开发了一个批量表格提取工具！然后就可以导出插件。<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 267px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 38.14%;"></div>
<div class="image-view" data-width="2926" data-height="1116"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-4aae5c40ec349fa4.png" data-original-width="2926" data-original-height="1116" data-original-format="image/png" data-original-filesize="171584" data-image-index="14" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
OK，我们可以测试一下插件安装和使用，安装好了，完美使用<br>
<div class="image-package">
<div class="image-container" style="max-width: 700px; max-height: 493px;">
<div class="image-container-fill" style="padding-bottom: 70.28999999999999%;"></div>
<div class="image-view" data-width="1380" data-height="970"><img referrerpolicy="no-referrer"  data-original-src="//upload-images.jianshu.io/upload_images/10518391-46f2de67ddb46571.png" data-original-width="1380" data-original-height="970" data-original-format="image/png" data-original-filesize="77585" data-image-index="15" style="cursor: zoom-in;" class="image-loading"></div>
</div>
<div class="image-caption"></div>
</div>
<br>
从此，我们可以直接用这个插件来批量提取行，可以发给你的实验室同门，大家都可以用了。
<h3>写在最后</h3>
<p>很强！当然，对于一些相对复杂的逻辑，或许需要比较具体的描述。总之，欢迎大伙联用两者，实现自己的想法，开发出有用，实用的插件，分享给朋友和所有TBtools用户。</p>
</article>

作者

sockstack

许可协议

CC BY 4.0

发布于

2023-11-14

修改于

2024-09-07

上一篇：软件：常用 Linux 软件汇总，值得收藏下一篇：OpenAI 再放大招，ChatGPT 正式版 API 就是救世主尼奥，而我们都是愚蠢的人类

尚未登录

无需编程 | 联用「chatGPT」和「TBtools」实现你的 idea，开发你梦寐以求的工具

文章分类

博客重构之路

Spring Boot简单入门

k8s 入门教程

MySQL 知识

NSQ 消息队列

ThinkPHP5 源码分析

使用 Docker 从零开始搭建私人代码仓库

日常开发汇总

标签列表

springboot

hyperf

swoole

webman

php

多线程

数据结构

docker

k8s

thinkphp

mysql

tailwindcss

flowbite

css

前端